内设机构：
党委办公室（巡察办公室）
校长办公室（法律事务办公室）
纪检处
党委组织部
党委宣传部
党委统战部
发展规划处
人事处（教师工作部）
财务处
审计处
教务处
科学技术院
学生处（学生工作部、武装部）
研究生院
研究生工作部
保卫处（部）
对外合作交流处
国有资产与实验室管理处
基建处
离退休工作处（部）
专门党务和群团部门：
党校
机关党委
直属部门党委
离退休教职工党委
校工会
校团委
校友会办公室
直属附属部门：
乡村振兴办公室
云南产业发展研究院
人文社科研究院
图书馆
档案馆
学报编辑部
就业指导中心
素质教育中心
信息化建设管理中心
工程训练中心
计算中心
分析测试研究中心
后勤保障服务中心
学生社区教育管理中心
招标与采购管理中心
校医院
资产经营有限公司
昆明理工教育发展集团有限公司
附属中学
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